Протягом доби після промивання сечового міхура можуть відчуватися часті позиви до сечовипускання і дискомфорт. Для полегшення симптомів можна використовувати нестероїдні протизапальні препарати. У випадках, коли печіння, поколювання і болі не минають протягом двох і більше днів після інстиляції, рекомендується звернутися до уролога. За необхідності для запобігання ускладнень після інстиляції (наприклад, у разі травмування уретри або сечового міхура) лікар призначить антибіотики.

При оральному прийомі медикаментів буває важко досягти потрібної концентрації ліків в сечі, яка необхідна для ефективного знищення патогенних мікроорганізмів, що спричиняють запалення. Інстиляція забезпечує значно вищу концентрацію медикаментів без загального впливу на організм, оскільки ліки діють локально в потрібній області. Перед проведенням процедури сечовий міхур повністю спорожняється, що забезпечує тривале перебування ліків в високій концентрації всередині сечового міхура. Це забезпечує максимальну ефективність лікування.