В течение суток после промывания мочевого пузыря могут ощущаться частые позывы к мочеиспусканию и дискомфорт. Для облегчения симптомов можно использовать нестероидные противовоспалительные препараты. В случаях, когда жжение, покалывание и боли не проходят в течение двух и более дней после инстилляции, рекомендуется обратиться к урологу. При необходимости для предотвращения осложнений после инстилляции (например, при травмировании уретры или мочевого пузыря) врач назначит антибиотики.

При пероральном приёме лекарств бывает сложно достичь нужной концентрации препарата в моче, которая необходима для эффективного уничтожения патогенных микроорганизмов, вызывающих воспаление. Инстилляция обеспечивает значительно более высокую концентрацию лекарств без общего воздействия на организм, поскольку препараты действуют локально в нужной области. Перед процедурой мочевой пузырь полностью опорожняется, что обеспечивает длительное нахождение лекарства в высокой концентрации внутри мочевого пузыря. Это обеспечивает максимальную эффективность лечения.